Vamos a ver, si entrenas a 6 jugadores, ¿para qué le vas a dar entreno triposicional pudiendo dárselo biposicional? La diferencia es el tiempo, tarda bastante más en triposicional. No sé si es esa tu pregunta, pero es lo que me das a entender (que no la entiendo muy bien :S).
Sobre como compaginar... lo uno no quita lo otro a menos que entrenes a jugadores en posiciones que no son las suyas, si entrenas a tíos de 18 años probablemente no ganes, pero no porque los entrenes, será porque aún están verdes. El ganar, siempre y cuando teniendo un entreno "normal", dependerá de tu equipo.